公元1181～1189年間，止貢巴·仁欽貝造其弟子巴登向秋能巴由西藏止貢替寺赴八邦傳演止貢噶舉教義，并主持修建了八邦寺的前身一二兄里寺大殿上座，在太殿鄰近的兩個(gè)山頭分別建起“著(zhù)郎干”講學(xué)院和“五且”坐經(jīng)院。寺廟舉行法會(huì )，則集合僧侶在曲池西（今鄉政府駐地）講經(jīng)授法。16世紀中葉，兄里寺被一名叫“阿熱”的炊事僧人失火焚毀。清初，從西藏阿里云游至德格的薩迦高僧赤稱(chēng)俄熱看中了八邦“三象戲水”的奇麗地形，在荒蕪的兄里寺原址建起一薩迦寺廟，但因規模不大，僧侶不多未獲發(fā)展。
清雍正六年（1728），出生于德格龔埡阿洛定日崗的噶舉名僧，被嘎瑪第十世-蓋西多吉認定為昌都嘎瑪寺第八世司徒-的司徒·曲吉龔勒于28歲時(shí)征得土司登巴澤仁允準，以龔埡班黨寺為母寺，在原兄里寺地址親自主持修建起噶瑪噶舉派的八邦寺；并在法王登巴澤仁的挽留下?lián)瘟税税钏轮鞒郑蛔鸱Q(chēng)為八邦寺第一代司徒-。此后，歷代轉世的司徒-均任八邦寺主持，不再任昌都嘎瑪寺主持。
八邦寺建成后礦在政教上都獲較大發(fā)展。寺廟自稱(chēng)“國師廟”，以元代所封國師噶瑪拔希（德格汪布頂人）曾任兄里寺主持，歷代供奉元憲宗賜與噶瑪拔希的金邊黑帽。《舊西康省康屬概況》記，第八世司徒曾得授朝廷“四寶法王”稱(chēng)號并劃撥德格土司人民，土地一半與八邦寺。乾隆年間，乾隆皇帝親筆書(shū)寫(xiě)“祈禱番根大益司徒”橫匾賜予寺廟并兩次詔請第八世司徒·曲吉龔勒赴京講經(jīng)民國時(shí)颯，-政府亦十分重視八邦寺在藏區的政教影響。1938年，劉文輝聘任司徒-為“五明學(xué)院”的康北宣教師，德格縣政府則安置司徒為縣參議會(huì )副參議長(cháng)。1940年，八邦寺清真一行8人應邀赴重慶參加“抗戰勝利祈禱法會(huì )"，蔣介石厚贈禮品并與清真等一行合影留念。八邦寺為德格土司第一家廟，在維護和鞏固政教合一的土司統治中有舉足輕重的位置。寺廟享有較高的政治特權，司徒-有權參加德格土司最高行政會(huì )議，土司轄區有關(guān)政治、經(jīng)濟、軍事、文化等重大活動(dòng)，制訂重大政令，大小頭人的升遷，以至土司嗣位大事，德格土司均要征得司徒的意見(jiàn)并認可。同時(shí)，德格土司又以法王的身份號令八邦寺。近百年來(lái)，八邦寺苘僧云集，宗教人才輩出。許多-、-均為研習“五明學(xué)”多有建樹(shù)的著(zhù)名學(xué)者，留下不少內容從佛學(xué)到天文學(xué)、詩(shī)明學(xué)、文學(xué)、醫藥學(xué)、文法、歷史、繪畫(huà)等學(xué)科的著(zhù)述。如第八世司徒·曲吉龔勒的《印度旅行記》t《詩(shī)學(xué)的解釋與參考》、《司徒文法廣釋》、《如意藤標簽》、《自傳圖名術(shù)》，尼麥曲杰翁波的《捉鬼記》、《花園里蜜蜂的遭遇》，貢珠·顏登降錯的《知識總匯》、白馬德西翁波的《自傳全集》，以及八邦寺近現代名僧降央部杰嘉措、降根洛珠塔顏、斯郎熱登戈日降巴、白馬根絨、巴登青則俄色等人的著(zhù)述均為涉及學(xué)科廣，頗有造詣和具有很大影響的優(yōu)秀作品。
八邦寺分母寺、于寺（分寺）兩部分，母寺有大、小經(jīng)堂各1座，設講經(jīng)院1所，設納若、根仁、黨母3所坐經(jīng)院。子寺有100多座，主要分布在青海、云南和四川甘孜州地區。寺廟設司徒、貢珠、清真、溫根4個(gè)-轉世系統。解放初統計，全寺有僧侶725人，其中-4人，外地留學(xué)-2人，堪布5人，職事-18人，一般-83人，扎巴613人；有森林、牧場(chǎng)近4000平方公里，有耕地2000余畝，牲畜4·3萬(wàn)頭（只），科巴（農牧）1000多戶(hù)，從事大宗的商業(yè)和0經(jīng)營(yíng)；寺廟文物有大型鍍金泥塑佛像7座，各類(lèi)紅黃銅菩薩9835尊，各個(gè)歷史時(shí)期唐嘎畫(huà)10150幅，經(jīng)典32400部，木刻印版129845張，純金譽(yù)寫(xiě)的? ??甘珠爾》1套，其它佛具和各個(gè)歷史時(shí)期的詔書(shū)、印章等近5000件。
解放后，廢除了八邦寺的政治和經(jīng)濟特權。“文革”期間，“造反派”開(kāi)展“破四舊”活動(dòng)，寺廟部分房屋被占用，寺廟財產(chǎn)、文物受到很大損失。1981年以后，寺廟建起16人組成的寺廟管理委員會(huì )，籌集資金修復了寺廟，逐漸發(fā)展寺廟自養經(jīng)濟。1988年，寺廟大殿維修竣工，新塑高15米、寬5米的彌勒佛銅殼塑像1尊，建起佛學(xué)院1所，恢復了"納若"和"根仁"2座坐經(jīng)院。全寺有僧侶375人，其中-4人（尚在印度），堪布3人。寺廟自養經(jīng)濟主要開(kāi)展采藥制藥、商業(yè)、雕塑、繪畫(huà)、建筑、養畜、印售經(jīng)書(shū)等活動(dòng)，年收入5萬(wàn)余元。
保護范圍：東至“通天梯”及“坐來(lái)直普”靠巖石處，南至水磨房刻瑪尼石房，西至“多泉房”及“屠宰溝”，北至“頂領(lǐng)圣佛”草坪
建設控制地帶：在保護范圍的基礎上向南延伸5米，向北延伸7米。